自1995年5月中办、国办下发《县级以下党政领导干部任期经济责任审计暂行规定》和《国有企业及国有控股企业领导人任期经济责任审计暂行规定》，县及乡镇相继出台了县、乡、村办集体企业法人代表，行政事业单位负责人、行政村负责人任期经济责任审计意见。经济责任审计在财务收支审计的基础上得到各级领导的重视，同时也收到了较好的效果。
按审计类别划分，经济责任审计和财务收支审计是审计其中一类；按审计的范围内容划分，经济责任审计的内容较广，称全面审计，而财务收支审计为专项审计，按审计的目的划分，经济责任审计是对党政领导干部、企业领导人员任期内经济责任的评价，为组织人事部门、企业领导人员管理机关提供干部任免信息；而财务收支审计是对单位财务收支状况真实、合法、效益及资金运转进行审计评价；按时间划分，经济责任审计时间范围是领导干部任期届满，或者任期内办理调任、转任、轮岗、免职、辞职、退休等事项前，而财务收支审计没有明确的时间界线。在实际审计中，经济责任审计与财务收支审计既有区别，又有联系，也有相同之处。
一、经济责任审计与财务收支审计的区别
1.审计项目的立项依据不同
经济责任审计一般不列入审计部门年初项目计划，而是由组织人事部门根据工作需要向审计机关提出审计的委托建议，安排审计部门在规定的时间对某些领导干部任期内经济责任进行审计。而财务收支审计是列入审计部门年初项目计划的。
2.审计的对象和内容不同
经济责任审计的对象是：党政领导干部、部门、单位负责人，企业法人代表。审计内容涉及面较广，既有经济活动又涉及财务领域。党委书记、乡镇长任期经济责任；任期内财政财务收支真实、合法、效益情况；乡镇企业利税情况；固定资产投入、农民负担情况；预算外资金管理使用情况；党政建设、财政财务收支的内容控制制度及其执行情况；组织部门安排的其他内容：企业资产、负债、损益的真实性；国有集体资产的安全、完整，保值、增值及对外投资和资产的处理情况；企业收益分配；与上述经济活动有关的内部控制制度执行情况；其他要审计的事项。
财务收支的对象是被审计单位，审计内容主要是财务收支的真实性、合法性。
3.审计的目的不同
经济责任审计是对领导干部、企业法人任期内的审计项目作出客观公正的评价，认定领导干部任期内政绩大小，为组织人事部门提供人才信息。把经济责任审计结果作为对干部实行\"三定\"的参考依据，即：定政绩、定奖惩、定位子。对政绩大的成绩突出的干部给予表扬奖励，提拨重用；对存在问题较小的一般实行打招呼、敲警钟、提警告；对问题严重的干部应当依法追究刑事责任的，移送司法机关处理。
财务收支审计的目的是检查财务收支真实、合规、合法性。在审计中发现管理混乱、严重违规违纪、乱挤乱摊费用给单位带来损失，再进一步查明领导个人对此应负的责任，只是财务收支审计的从属内容，不是财务收支审计的目的。
4.审计要求提供的资料及责任归属不同
经济责任审计在准备阶段，除要求部门和单位提供有关资料外，领导干部本人还应按要求写出自己负有主管责任和直接责任的财政收支、财务收支事项的书面材料，并于审计工作开始5日内递交审计机关。实施阶段要对领导人任职期间财务收支及经济工作目标数据进行核实，对发现的问题取得充分证据。对领导干部应负的直接和间接责任划清责任归属，如区分前任和继任领导干部责任；对遗留问题区分形成和解决责任，同时还要区分层次责任，明确领导人自身决策、民主决策，同主管领导部门干预和执行人员所负责任。
财务收支审计不要领导干部提供上述书面材料，对领导干部应负的直接和间接责任一般不作分层归属评价。
5.审计报告结论的写法不同。
经济责任审计结果报告，除财务收支方面要作出是否真实、合法、效益结果外，还要对领导干部所在的部门，单位各项经济指标进行对比，作为全面结论客观公正反映与评价领导干部任期内经济责任。其评价侧重点在于对领导干部本人，而非对事。即重点是对领导干部任期内应承担经济责任进行审计，对投资项目经济责任进行界定，对资产负债表表述的业绩作出说明，并具体说明潜在基础上的性质、内容对财务状况影响、对潜在的损失、潜在的负债还应说明离任人应承担的直接或间接责任。
财务收支审计报告是对被审计单位财务收支的发生作出真实合法效益情况评价，对人一般不作评价。
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