福州海关有关人士指出，目前，技术性贸易壁垒和质量安全问题已成为福建省农产品出口的主要障碍。近年来，技术性贸易壁垒已直接使中国农产品出口遭受巨大损失。据商务部调查，中国有九成农业及食品出口企业受国外技术性贸易壁垒影响，每年损失约九十亿美元，出口受阻的产品从蔬菜、水果、茶叶、蜂蜜扩展到畜产品和水产品 .
据悉，自二00七年以来，被国外炒作的中国食品安全事件超过二十起。以日本市场为例，由于受“肯定列表制度”影响和今年一月“毒饺子”事件影响，今年上半年福建省农产品对日本出口大幅下降，福建省输日农产品占福建省农产品出口比重由肯定列表制度实施前的百分之四十二下降到百分之二十三。
此外，出口企业规模较小也困扰福建农产品出口。目前，福建省农产品企业平均出口额仅为一百四十六万美元，企业普遍规模较小，组织化程度低，抵御出口市场风险和突破技术壁垒能力弱。在闽全省一千零一十二家有出口实绩企业中，超千万美元的仅有二十九家，近七成企业出口规模不足百万美元。