企业为职工代扣代缴个人所得税有两种情况：第一，职工自己承担个人所得税，企业只负有扣缴义务；第二，企业既承担税款，又负有扣缴义务。举例说明如下：
第一，企业作为个人所得税的扣缴义务人，应按规定扣缴该职工应缴纳的个人所得税。代扣个人所得税时，借记“应付工资”科目，贷记“应交税金——代扣代缴个人所得税”科目。
例1：企业为职工顾某发放9月份工资3600元。税款由顾某自己承担，企业负责代扣代缴。
顾某应纳税额＝（3600－800）×15％－125＝295（元）。
月末发放工资时，账务处理为：
借：应付工资3600
贷：现金3305
应交税金——代扣代缴个人所得税295
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第二，企业为个人代负个人所得税通常有两种情况：一是按照合同或者协议规定，纳税义务人应纳的个人所得税全部或部分由企业负担。这种情况通常是企业的自愿行为。二是因企业未履行扣缴义务，个人所得税由企业赔缴。这种情况是税法对企业未履行扣缴义务的一种“处罚”。企业除了赔缴税款外，还需按规定缴纳一定数量的滞纳金和罚款。
由于个人所得税是对取得应税收入的个人征收的一种税，其税款本应由个人负担。企业代纳税人负担的税款属于与企业经营活动无关的支出，应记入“营业外支出”科目。与之相适应，企业代负的个人所得税也不得在企业所得税前扣除，在年终申报企业所得税时，应全额调增应纳税所得额。
例2：企业为职工王某发放9月份工资3200元。按协议规定，王某个人所得税由该企业承担。按照国税发[1995]065号文件的规定，应纳税额计算如下：
应纳税所得额＝（不含税收入额－800－速算扣除数）÷（1－税率）
＝（3200－800－125）÷（1－15％）＝2676.47（元）；
应扣缴个人所得税＝应纳税所得额×适用税率－速算扣除数＝2676.47×15％－125＝276.47（元）。
账务处理如下：
借：营业外支出276.47
贷：应付工资276.47
若该企业当年度税前利润总额为120000元，营业外支出账户中列支代负本单位职工的个人所得税税额为30000元，不考虑其他纳税调整因素。则：
全年应纳税所得额＝120000＋30000＝150000（元）；
应纳企业所得税额＝150000×33％＝49500（元）。
需要说明的是，有人认为，企业支付的工资本应是含税的，企业代负的税款和职工实际取得的收入，是企业本应支付给职工的含税工资。因此，应将为职工代负的个人所得税，记入应付工资账户贷方和相应的科目中，以体现实际发放工资总额的真实性。即借记“管理费用、生产成本”等科目，贷记“应付工资”科目，同时借记“应付工资”科目，贷记“应交税金——代扣代缴个人所得税”科目。这种处理方法，实际上是将本应由个人负担的个人所得税名正言顺地改由企业负担。这与国家开征个人所得税的意义直接相违背，其结果必将增加企业的成本，从而减少了企业所得税。笔者认为，企业代纳税人负担个人所得税，不能以牺牲国家税款为代价。因此，在进行会计处理时，不宜将企业代为负担的个人所得税计入有关成本费用科目中。
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